En général ce genre de message indique que ton disque dur rencontre quelques problèmes de clusters, ou bien que la fermeture du système a été fait à "l'arrache" (coupure de courant ou arrêt brutal)
Des pistes dans la faq du site :
Le fichier ntldr manque ou est missing?Et penser à faire un test de surface du disque, un chkdsk si tu n'arrives pas à le faire depuis Windows.